Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms