Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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