Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6BQ9NRW1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms