Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT23Q9C075 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms