Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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