Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms