Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRC3Q9BY71 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms