Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYCP2Q9BX26 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYCP2Q9BX26 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms