Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms