Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCMBPQ9BTE3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms