Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms