Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms