Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG4Q92954 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms