Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHF3Q92576 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHF3Q92576 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms