Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NCSTNQ92542 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCSTNQ92542 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms