Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C11orf40Q8WZ69 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C11orf40Q8WZ69 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C11orf40Q8WZ69 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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C11orf40Q8WZ69 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
C11orf40Q8WZ69 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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C11orf40Q8WZ69 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C11orf40Q8WZ69 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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