Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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