Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIEQ8NEW7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms