Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLF2Q8IX21 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.9 ms