Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZNF493Q6ZR52 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms