Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC141Q6ZP82 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC141Q6ZP82 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC141Q6ZP82 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC141Q6ZP82 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC141Q6ZP82 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC141Q6ZP82 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC141Q6ZP82 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC141Q6ZP82 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC141Q6ZP82 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC141Q6ZP82 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms