Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27BQ5VT28 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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