Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms