Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLPPQ16740 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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