Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NTRK3Q16288 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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