Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTH1Q15438 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CYTH1Q15438 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CYTH1Q15438 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CYTH1Q15438 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CYTH1Q15438 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CYTH1Q15438 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CYTH1Q15438 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTH1Q15438 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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