Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB35Q15286 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms