Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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PTPRRQ15256 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRRQ15256 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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