Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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