Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NCF4Q15080 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms