Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RFTN1Q14699 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RFTN1Q14699 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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RFTN1Q14699 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RFTN1Q14699 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RFTN1Q14699 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RFTN1Q14699 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RFTN1Q14699 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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