Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3AQ14563 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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