Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms