Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAPSQ13938 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms