Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2BQ13554 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms