Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
EIF4EBP1Q13541 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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