Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RLFQ13129 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RLFQ13129 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RLFQ13129 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RLFQ13129 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RLFQ13129 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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