Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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