Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRJQ12913 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms