Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF5Q12774 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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