Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LTBQ06643 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LTBQ06643 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms