Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREMQ03060 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms