Protein–RNA interactions for Protein: Q02833

RASSF7, Ras association domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF7Q02833 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF7Q02833 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms