Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms