Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKOR1P84550 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms