Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms