Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CDKN1BP46527 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms