Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms