Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms