Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms